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Admixture-Studio-Leitfaden

Fokus auf einen Satz
von DNA-Segmenten.

Bereiten Sie Segmentgrenzen vor, führen Sie einen ausgewählten Rechner aus und vergleichen Sie modellabhängige genetische Ähnlichkeit.

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Admixture Studio ermöglicht die Analyse ausgewählter Segmente einer Ziel-RAW-Datei. So können Sie vergleichen, wie ein gewähltes Modell diese Segmente beschreibt, einschließlich Grenzen aus der Kompositionsdatei eines anderen Dienstes.

Schritt 01

Segmentvorlage vorbereiten

Erstellen Sie eine Textvorlage in einem Editor mit den Spalten Chromosom, Startpunkt und Endpunkt.

Segmentvorlage
Chromosome,Start Point,End Point
7,32000000,43000000

Segmentvorlage in einem Texteditor
Ein Chromosom und zwei Koordinatengrenzen definieren das Segment.
Schritt 02

Grenzen einfügen und prüfen

Kopieren Sie die Vorlage und nutzen Sie die Schaltfläche Paste im Bereich Segment to Analyze. Prüfen Sie die hinzugefügten Segmente, bevor Sie fortfahren.

Paste-Schaltfläche im Bereich Segment to Analyze
Fügen Sie die vorbereitete Segmentvorlage in die Anwendung ein.
Hinzugefügtes Segment in Admixture Studio
Prüfen Sie die Segmentliste, bevor Sie den Rechner starten.
Schritt 03

Ausgewählten Rechner ausführen

Nach Abschluss der Auswahl führen Sie den Rechner im Modus Genomewide auf der Ziel-RAW-Datei aus. Prüfen Sie die Ausgabe im Ergebnisfenster zusammen mit Methode, Einstellungen und Referenzen.

Ergebnisfenster von Admixture Studio
Lesen Sie die Ausgabe im Kontext von Rechner und Referenzen.

Ein anderer Rechner oder ein anderes Referenzpanel kann dieselben Segmente anders darstellen. Ein Vergleich ist keine unabhängige Verifikation einer genealogischen Schlussfolgerung.

Alternatives Eingabeformat

23andMe Ancestry Composition CSV

Wenn Sie bereits einen kompatiblen Kompositionsexport haben, kopieren Sie die zu analysierenden Segmente in eine neue Textdatei. Fügen Sie diese Kopfzeile als erste Zeile hinzu:

CSV-Kopfzeile
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point

Das Beispiel unten zeigt die erwartete Spaltenstruktur. Prüfen Sie Bezeichnungen und Koordinatenkonventionen des aktuellen Exports, bevor Sie eigene Daten verwenden.

CSV-Beispiel
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point
Northwestern European,2,chr6,120583383,170919470
Northwestern European,1,chr7,127233279,142841959
Northwestern European,1,chr7,145109518,146814694
Northwestern European,1,chr7,148036377,149542524
Northwestern European,2,chr12,3155321,95931927

Führen Sie den ausgewählten Rechner auf der Ziel-RAW-Datei aus und prüfen Sie die Ausgabe auf der Ergebnisseite. Exportformate und Oberflächen können sich ändern; diese Screenshots dokumentieren den in diesem Leitfaden gezeigten Ablauf.

Beispiel-Ergebnisfenster nach Ausführung auf der Ziel-RAW-Datei
Beispiel der Ergebnisansicht. Dieses Bild ist keine neue Analyse Ihrer Datei.