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Guia do Admixture Studio

Céntrate num conjunto
de segmentos de DNA.

Prepare os limites dos segmentos, executa uma calculadora selecionada e compara a similaridade genética segundo o modelo.

Leia o guia

O Admixture Studio permite analisar os segmentos selecionados de um arquivo RAW de destino. Isto pode ajudá- lo a comparar como descreve esses segmentos um modelo específico, incluindo os limites recolhidos no arquivo de composição de outro serviço.

Passo 01

Prepare um modelo de segmentos

Cria um modelo de texto sem formato no Bloc de notas com as colunas de cromossoma, ponto inicial e ponto final.

Modelo de segmentos
Chromosome,Start Point,End Point
7,32000000,43000000

Modelo de segmentos num editor de texto sem formato
Um cromossomo e dois limites de coordenadas definem o segmento.
Passo 02

Cola e revisa os limites

Copia o modelo e use o botão Paste do painel Segment to Analyze (Segmentos a analisar) . Verifique os segmentos adicionados antes de continuar.

Botão Paste do Painel Segment to Analyze
Cola o modelo de segmentos preparado na aplicação.
Segmento adicionado em Admixture Studio
Verifique a lista de segmentos antes de executar a calculadora.
Passo 03

Executa a calculadora seleccionada

Depois de completar a selecção, executa a calculadora em modo Genomewide (genoma completo) sobre o arquivo RAW de destino. Verifique o resultado na janela de resultados, juntamente com o método, a configuração e as referências selecionadas.

Janela de Resultados do Admixture Studio
Leia a saída no contexto de sua calculadora e suas referências.

Uma calculadora ou um painel de referência diferente pode oferecer outra perspectiva dos mesmos segmentos. Uma comparação não constitui uma verificação independente de uma conclusão genealógica.

Outro formato de entrada

CSV de composição de ascendência de 23andMe

Se você já tiver uma exportação de composição compatível, copia os segmentos que você deseja analisar num novo arquivo de texto sem formato. Adicione este cabeçalho como primeira linha:

Cabeçalho CSV
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point

O exemplo seguinte mostra a estrutura de colunas esperada. Verifique as marcas e as convenções de coordenadas da exportação actual antes de usar os seus próprios dados.

Exemplo CSV
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point
Northwestern European,2,chr6,120583383,170919470
Northwestern European,1,chr7,127233279,142841959
Northwestern European,1,chr7,145109518,146814694
Northwestern European,1,chr7,148036377,149542524
Northwestern European,2,chr12,3155321,95931927

Executa a calculadora seleccionada sobre o arquivo RAW de destino e verifique a saída na página de resultados. Os formatos de exportação dos fornecedores e das interfaces podem mudar; estas capturas documentam o processo mostrado neste guia.

Exemplo da janela de resultados após a execução do arquivo RAW de destino
Exemplo da interface de resultados. Esta imagem não é uma nova análise do seu arquivo.