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HG19 / HG38 / Conversión de coordenadas

Los mismos datos de origen.
Un mapa de coordenadas diferente.

Una herramienta puede necesitar un ensamblaje de referencia distinto del de tu archivo. El liftover detecta el ensamblaje de origen y convierte los datos RAW o VCF compatibles al otro ensamblaje.

$15.71Servicio de pago único. Sin suscripción.

La conversión de coordenadas no es una nueva secuenciación ni una imputación. Se excluyen las posiciones que no pueden mapearse sin ambigüedad.

Elige según tu archivo de entrada

El formato determina
qué recibes.

Ambos procesos convierten coordenadas compatibles. Sus formatos de descarga son diferentes y ninguno añade posiciones no analizadas.

Si partes de un archivo RAW

Utiliza una exportación RAW compatible en HG19 o HG38. El ensamblaje convertido se entrega como RAW en ZIP y VCF comprimido con las mismas posiciones analizadas.

  • Resultado RAW en ZIPTexto RAW de tipo comercial con estructura canónica en el ensamblaje convertido.
  • Resultado VCF comprimidoUn segundo formato para las mismas posiciones mapeadas, no un VCF de genoma completo.

Si partes de un archivo VCF

Utiliza un VCF compatible, sin comprimir o comprimido, en HG19 o HG38. El resultado es un VCF comprimido en el otro ensamblaje.

  • Resultado VCF comprimidoRegistros de variantes mapeados y preparados en el sistema de coordenadas de destino.
  • La cobertura de origen sigue siendo un límiteLa conversión no mide variantes ausentes ni sustituye datos no disponibles.
El proceso de conversión de coordenadas

Detecta el ensamblaje.
Mapea las posiciones.

Confirma primero el ensamblaje que necesita la siguiente herramienta. Utiliza la conversión cuando el ensamblaje de origen compatible sea distinto.

  1. Aporta el archivo de origen

    RAW o VCF / Conserva una copia

    Sigue las instrucciones de envío del pedido. Las entradas admitidas incluyen exportaciones RAW de pruebas comerciales y archivos VCF sin comprimir o comprimidos.

  2. Detecta y convierte

    HG19 a HG38 / HG38 a HG19

    Se detecta el ensamblaje de origen y se convierten las posiciones compatibles al otro ensamblaje. Se excluyen las posiciones ambiguas o sin correspondencia.

  3. Revisa el archivo convertido

    Comprueba el proceso de destino

    Utiliza el formato entregado adecuado para la siguiente herramienta y confirma sus requisitos de ensamblaje y cobertura antes de compartir el resultado.

Qué cambia / Qué sigue siendo un límite

Un cambio de coordenadas,
con límites de correspondencia.

Los ensamblajes de referencia son diferentes. Una posición que se mapea sin problemas en una región puede no tener una correspondencia inequívoca en otro ensamblaje.

Cambia
El sistema de coordenadas utilizado para describir posiciones de variantes compatibles.
No añade
Nuevas mediciones, cobertura de secuenciación ni variantes no genotipadas inferidas.
Pueden excluirse
Las posiciones que no pueden mapearse sin ambigüedad entre los dos ensamblajes. Conserva el archivo original para comparar.
Siguen siendo independientes
Las normas de aceptación de terceros y las restricciones de uso clínico. La coincidencia del ensamblaje no garantiza por sí sola la idoneidad.
Contrata el servicio

Un archivo compatible.
El otro ensamblaje de referencia.

Elige el servicio tras comprobar si el destino necesita HG19 o HG38. El tipo de archivo determina los formatos de resultado disponibles.

Servicio de conversión de pago único

Conversión de coordenadas de ADN (HG19 / HG38)

Convierte las coordenadas de un archivo RAW o VCF compatible de HG19/GRCh37 a HG38/GRCh38, o en la dirección inversa.

$15.71

Tu compra de un vistazo

Recibes
Posiciones de origen mapeadas sin ambigüedad en el otro ensamblaje de referencia compatible. Entradas RAW: RAW en ZIP y VCF comprimido. Entradas VCF: VCF comprimido.
Incluye
Un archivo RAW o VCF compatible, convertido entre HG19/GRCh37 y HG38/GRCh38.
Acceso
Servicio de conversión de coordenadas de pago único; la disponibilidad de descarga se indica en el producto entregado.
Necesitas
Un archivo de origen compatible en HG19 o HG38 y un requisito claro de ensamblaje de destino.
No incluye
Se excluyen las posiciones ambiguas o sin correspondencia. No incluye alineamiento de lecturas a T2T, imputación ni nueva detección de variantes.

Después de comprarSigue las instrucciones de envío del pedido. Descarga el archivo convertido desde el producto adquirido y conserva la identificación de su ensamblaje de referencia de salida.

Abrir tus compras (en inglés)
  • Detección del ensamblaje de origen
  • RAW y VCF comprimido para entradas RAW, o VCF comprimido para entradas VCF
  • Posiciones mapeadas sin ambigüedad en el otro ensamblaje de referencia
Comprar Conversión de coordenadas de ADN (HG19 / HG38) (en inglés)

Sigue las instrucciones de envío del pedido. Consulta la información de tratamiento, consentimiento y conservación de ese proceso y la política de privacidad. Solo para investigación y educación; estos archivos convertidos no deben utilizarse para diagnóstico clínico ni decisiones médicas.

Antes de contratar

Mantén el ensamblaje
en su contexto.

Las coordenadas de referencia indican dónde se sitúa un registro; no implican que se haya medido ADN adicional.

¿Qué es un ensamblaje del genoma de referencia?

Un ensamblaje del genoma de referencia es el sistema de coordenadas utilizado para describir posiciones en cada cromosoma. HG19/GRCh37 y HG38/GRCh38 son ensamblajes distintos; la herramienta receptora puede requerir uno concreto.

¿Tengo que identificar el ensamblaje de origen antes de contratar?

El servicio detecta si una entrada compatible está en HG19 o HG38 y la convierte al otro ensamblaje. Debes comprobar qué ensamblaje necesita el destino.

¿Qué tipos de archivo son compatibles?

Las entradas admitidas incluyen exportaciones RAW de ADN y archivos VCF compatibles, sin comprimir o comprimidos, en HG19/GRCh37 o HG38/GRCh38. Contacta con soporte si el formato o el ensamblaje de origen no está claro.

¿Qué recibo si aporto un archivo RAW?

Las entradas RAW reciben un archivo RAW de tipo comercial en ZIP y un VCF comprimido con las mismas posiciones analizadas y mapeadas en el ensamblaje convertido. El VCF no es un archivo de genoma completo.

¿Qué recibo si aporto un archivo VCF?

Las entradas VCF reciben un VCF comprimido en el otro ensamblaje compatible.

¿Pueden perderse posiciones durante el liftover?

Sí. Se excluyen las posiciones sin correspondencia inequívoca entre HG19 y HG38. Conserva el archivo original y revisa el resultado convertido antes de utilizarlo en otro proceso.

¿Realiza alineamiento a T2T o imputación?

No. Este servicio convierte coordenadas existentes compatibles entre HG19 y HG38. No realinea lecturas de secuenciación, ni crea un ensamblaje ni infiere variantes no genotipadas.

¿El resultado es adecuado para decisiones médicas?

No. El liftover está destinado a procesos de investigación y educación. Los archivos convertidos no deben utilizarse para diagnóstico clínico ni decisiones médicas.

¿Necesitas cambiar el formato en lugar del ensamblaje?

Si tus coordenadas ya están en el ensamblaje adecuado, puede que necesites un servicio de conversión de formato.

RAW a VCF

Representa registros RAW compatibles en un archivo de variantes.

Explorar RAW a VCF
Conversión de coordenadas de ADN

Utiliza el sistema de coordenadas que necesita tu herramienta.

Revisa el ensamblaje requerido, conserva el archivo original y contrata el liftover HG19/HG38 adecuado.

Analizamos ADN antiguo y actual desde 2018

DNA Genics desarrolla informes de ascendencia y análisis de ADN desde 2018, con paneles de referencia, calculadoras y comparaciones con genomas antiguos desarrollados y revisados por nuestro equipo. Las funciones opcionales que utilizan IA se identifican como tales.

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