模型与比较.
在解释其数字之前,先指明参考空间和估计数的类型。
ADMIXTURE 与成分模型这些组件代表什么?
基于 Genotype 的混合模型估计观察到的变异如何适合一组统计组件. K 是组件的数量. 改变 K 或参考面板会改变问题; 较大的 K 不是一个自动更好的匹配.
- 投入
- 可使用的基因型标记和模型的参考数据.
- 所显示的
- 与该模型相比,构件估计值是不同的计算,需要自己的方法描述。
- 仔细阅读
- 一个组成部分不是国籍、身份或历史人口数的分数,小估计数对模型选择和噪音可能很敏感。
公共目录浏览是免费的,个人分析需要适当的处理样本;独家收藏有单独的访问权限.
浏览混合成分计算器- A: 30%
- B: 24%
- C: 20%
- D: 16%
- E: 10%
图中使用虚构数值，不代表个人结果。成分取决于模型及其参考数据。
G25 与坐标表示让我比较一下坐标是多少?
坐标汇总了特定参考空间的变异性. 兼容行支持距离,适应群模型和视觉探索. DNA Genics 坐标生成生成产生模型的 G25 式估计;它不是直接的基因型PCA投射到另一个提供者的空间.
- 投入
- 用于比较:兼容坐标,缩放和参考空间. 生成坐标有自己的DNA样本要求.
- 所显示的
- 接受这种格式和空间的工具的数字表示。
- 仔细阅读
- 仅匹配列数并不能确定兼容性。坐标不是百分比,混合表示会误导距离。
25国集团的基本勘探是免费的,有适当的坐标,在提供坐标生成和Pro方法时是单独的付费能力。
查看坐标生成服务- 圆点：参考组 A
- 方块：参考组 B
- X：示例点
图中位置为虚构示例。比较时，坐标体系、尺度和参考空间须相互兼容。
PCA 与 UMAP 投影在阴谋上的立场意味着什么?
PCA 代表基因变异的选定轴,可以将样本放入现有的参考空间进行对比. UMAP是一种不同的维度减小方法,它有自己的设置和几何学,报告或工具决定使用哪种表示.
- 投入
- 根据特定工具的要求,兼容基因类型或协调数据以及定义的参考面板。
- 所显示的
- 数据中相对结构的视角,而非地理地图.
- 仔细阅读
- 参考取样、预处理和设置会影响地块。视觉近距离性不是经过校准的家庭关系或地理来源证明。
关于 UMAP : 其邻里结构和设置与 PCA 不同。类似外观的地块不会使其轴线或距离可以互换。可视化不一定是报告得分的输入 。
Basic Studio包含有兼容输入的自由入口. 独立高级可视化需要相关的PRO访问.
Explore G25 Studio单倍群分析支持哪一个家族分支?
部分Y-chromosome和线粒体标记可以支持父系或母系树上的一个位置。 分支描述一个家族视角,不同于自体人口比较。
- 投入
- 在上传文件中有足够的信息Y-DNA或mtDNA标记.
- 所显示的
- 标记允许的分辨率下支持的共享分行 。
- 仔细阅读
- 共享分支不会识别一个特定的命名祖先,建立近代的家庭关系或描述一个人的所有祖先. 覆盖范围可以限制或阻止预测.
报告准入和标记覆盖范围是不同的要求,在选择购买之前先审查相关产品和样品。
查看报告选项Y-DNA
mtDNA
图中仅显示部分分支，省略中间分支，不按时间比例绘制。共享谱系分支无法确定某个具名亲属，也无法概括全部遗传祖源。
仔细看看数据。
这些方法询问 Allele 安排、 单个标记和染色体间隔。 所需输入因工作流程而异 。
DNA phasing哪个变体属于同一个副本?
分期评估如何在两个染色体副本中排列观测到的亚麻黄素,它可以为基于杂交类型的分析准备数据。单是分期评估并不能确定哪些副本是母型或父型的;分配原父母需要更多信息。
- 投入
- 适当的基因类型数据和分阶段方法所需的投入。
- 所显示的
- 估计的杂交型:染色体副本上的亚麻安排.
- 仔细阅读
- 统计阶段可以包含错误. 分阶段复制不是测量的亲子基因组,复制品不应自动与亲子名称贴上标签.
如果有单独的处理能力,请审查文件要求、采购范围和现有访问。
查看定相服务图中展示一种虚构的定相结果。仅靠统计定相无法确定哪份拷贝来自父亲或母亲，还需要其他信息。
局部祖源推断染色体上的任务有什么不同?
本地祖先推论将染色体间隔分配给统计参考元件. 染色体绘画显示沿染色体的模型任务,补充全样本摘要.
- 投入
- 兼容的染色体一级数据、参考面板和选定执行所需的任何准备。
- 所显示的
- 基因组间隔的依赖性任务。
- 仔细阅读
- 颜色代表模型组件,每个间隔的地理来源没有被验证。 类似的参考组可能很难区分 。
方法取决于报告或工具。本指南并不保证每个计算器都提供本地祖先推论 。
浏览成分分析选项共享片段：IBS 与 IBD匹配段支持什么 ?
国家身份(IBS) 描述在比较标记时匹配观察到的 Allees. 身份(IBD) 描述通过共享祖先来源继承的一段. iBD是从数据和假设中推断的; 仅一个标记匹配并不能证明这一点.
- 投入
- 可比较的标记数据,合适的覆盖度和片段方法的质量阈值. 亲和导出与RAW 基因型文件不同.
- 所显示的
- 共用标记或部分证据,在有支持之处有关系估计。
- 仔细阅读
- 短或稀疏的匹配可能偶然发生,也可能通过人口历史发生. 长度,标记密度,分阶段和假设会影响信心;匹配不会证明一种命名的关系.
染色体浏览器显示其选定方法报告的匹配间隔。该显示本身并不建立继承或关系。
当前亲属分析器可以免费使用支持的亲属导出并使用服务器处理.其他部分的工作流程有自己的要求.
了解 DNA 匹配分析工具图示四个位点的虚构判定。IBS 指观察到相同的等位基因。推断 IBD 还需要片段及统计证据。
古人类基因组 SNP 比较古老的相似性算什么?
尼安德特人和杰尼索夫人比较报告将观测到的SNP变体与其古老的参考基因组进行比较。它们基于计数的相似性涉及测试位置和参考比较,而不是一个坐标图。
- 投入
- 可使用的基因型位置与报告过时的参考数据重叠.
- 所显示的
- 将测试过的变体与所比较的位置相匹配.
- 仔细阅读
- 这不是直接测量的基因组中过时的百分比,覆盖范围、参考选择和人类共有的变异影响比较。
这些报告的产品有自己的获取和覆盖要求,仅上传并不能解锁付费报告。
浏览古人类参考样本报告基因型填补未测试的位置是如何估计的?
假象使用观测到的标记和参考霍普洛型模式来估计额外位置可能存在的基因型,为适当的下游工作流程提供统计估计,而不同位置和参考范围的信心各不相同。
- 投入
- 一个兼容的基因型文件,有可用的标记和一个合适的参考面板.
- 所显示的
- 估计额外基因型呼叫和具体产出。
- 仔细阅读
- 估计的呼号并不是新的测量或测序。 更多的估计标记不能保证更准确的下游结果。
如果有单独的处理能力,请审查所支持的输入、 输出格式和购买范围 。
查看 DNA 基因型填补服务图中使用虚构位点。根据参考数据可为未检测位点估算可能的基因型；这并不会增加实验室实测结果。
三个数字。
不同义.
在比较两个结果之前先检查标签和计算.
- 距离
- 在一个特定的计算中,相对相似性。较小的表示比较更接近于兼容的输入和缩放。距离不是百分比或关系概率。
- 部件或装配重量
- 在指定的模型中进行估计。基于基因类型的组件估计和与坐标匹配的权重是不同的计算,即使两者都作为百分比出现。
- 坐标
- 特定代表位置:参考空间、格式和缩放事项;坐标不是地理位置。
在比较结果之前
- 检查参考面板 。谁是代表,还缺少什么?
- 检查可用的输入 。比较了哪些标记、间隔或协调代表?
- 请检查access-date=中的日期值 (帮助) 假设.哪些设置、准备和质量阈值决定了输出?
- 请检查date=中的日期值 (帮助) 版本和目的.模型更新可以改变估计值,不同的问题需要不同的方法.
留着证据
从角度来说。
结果描述了遗传相似性或统计估计,没有确立种族、国籍、文化身份或一种指定的家庭关系。
一个缺失的比较问题。
代表性不足的人口或时期会影响样本的合适之处,而精确的数值并不能消除这种不确定性。
一个小的估计需要背景。
选中的标记、 引用和设置可以改变估计值。若干类似的输出不是自动独立的证据 。
用意问.
这些报告和工具支持教育探索,不是临床诊断、法律证据,也不是文献系学的替代品。
阅读
方法 方法 方法 方法
主要的研究和方法文献提供了背景,这些链接并不意味着每个报告都使用指定的软件,或者其作者都认可DNA基因学.
- ADMIXTURE 作者文档组件 K 和模型选择 。
- McVean:主要组成部分分析的基因解释采样和人口解释的局限性.
- PLINK:IBS和IBD估计比较标记,估计和假设.
- SHAPEIT 方法术语表Haplo型,相位式和推算式.
每个报告都使用G25吗?
否. 不同报告使用不同组合的基于基因型的组件模型,预测,标记比较,片段方法和线条分析 读取具体报告的方法描述 G25是一个基于坐标的工作流程,而不是对每个结果的普遍解释.
为什么两个模型给出不同的百分比?
参考文献、选定的标记、假设和组件计数可能有所不同。 坐标匹配的混合物重量和基于基因型的ADMIXTURE估计数也是不同的计算。 将输出与其方法和参考背景进行比较。
距离小一点会更好吗?
如果数据、缩放和参考空间相容,较小的距离意味着在计算中更加相似,而不是血统百分比、关系概率或地理来源证明。
分期鉴定我父母的DNA吗?
分期估计染色体拷贝上的亚麻的排列,单是分期估计并不能确定哪一份是母亲或父亲;原父母的标签需要更多的信息,统计阶段可能包含错误。
IBS和IBD有什么区别?.
IBS 描述在比对标记时所观察到的 Alles 匹配. IBD 描述共享继承,并使用数据和假设来推断. 短或稀有的匹配本身并不能证明特定的共享祖先或家庭关系.
插图是我的结果吗?
编号。 组件值、 坐标位置、 标记匹配和估计调用都是被发明的图例。 线条树显示选定的分支, 中间分支被省略,没有时间尺度 。
上传是否与购买访问相同?
否. 上传开始样本工作流程, 并可以提供可用的免费报告。 报告产品、 协调生成、 高级 PRO 工具和 AI 访问有自己的要求和条件。在购买前先审查已有的访问 。
我该从哪里开始?
使用 Studio 为您的目标和现有数据选择工作流程。 使用兼容的 RAW DNA 文件,审查上传选项。 使用合适的 G25 坐标, 探索免费的基本比较工作流程。 软件包和产品指南解释付费选项 。