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HG19 / HG38 / 坐标升降

同一来源数据.
不同的坐标图。

一个工具可以期望您文件中的参考构建不同。 Fellowover 检测到源构建,并将支持的 RAW 或 VCF 数据重映射到相反的构建中 。

$14.55一次性服务,不订阅.

坐标重映射并不是新的排序或推算,无法清晰映射的位置被排除在外。

由您的输入选择

格式决定
你得到的东西。

两种工作流程都支持坐标重映射。它们的下载格式不同,也没有增加未经测试的位置。

从 RAW 文件开始

使用 HG19 或 HG38 中支持的 RAW 导出。 转换后的构建是作为 RAW 文件的拉链和包含相同测试位置的压缩 VCF 提供的 。

  • zipped RAW 输出在转换的建筑中,加农科消费风格的RAW文本.
  • 压缩 VCF 输出第二种格式用于同一图示位置,而不是全基因的VCF.

从 VCF 文件开始

在HG19或HG38中使用一个支持的平面或压缩的VCF,结果是相反构造中压缩的VCF.

  • 压缩 VCF 输出目标坐标系统所制备的变种记录。
  • 保留源覆盖范围作为限制转换不会测量缺失的变体或替换无法获取的数据.
重新绘制工作流程

探测建筑物。
地图位置。

首先确认下一个工具预期的构建。然后当支持的源构建不同时使用转换 。

  1. 提供来源

    RAW 或 VCF / 保留备份

    遵循您订购的文件提交指令。 支持的输入包括消费者 RAW 输出和简单或压缩的 VCF 文件 。

  2. 检测和重新映射

    HG19改为HG38 / HG38改为HG19

    检测到源建并重新将辅助位置移到相反的建筑中。 模糊或不适用的位置除外 。

  3. 审查已转换的文件

    检查目标工作流程

    在分享结果之前,使用符合您下一个工具的已交付格式并确认其构建和覆盖要求。

什么变化 / 是什么保持一个限制 。

坐标变化,
带有绘图限制。

参考组件不同,一个地区的地图清晰无误,在另一个建筑中可能没有明确的对应物。

变动
用于描述所支持的变位的坐标系统.
不添加
新的测量,测序覆盖或推断出无型变种.
可排除在外
无法在两者之间清晰映射的位置 。 保留原始文件以供比较 。
仍然独立
第三方接受规则和临床使用限制,单是匹配的建筑并不能保证适合性.
购买服务

一个支持的文件 。
与此相反的参考建筑。

在检查目的地是否期望 HG19 或 HG38 之后选择服务。文件类型决定了可用的输出格式 。

一次性转换服务

DNA 坐标转换(HG19 与 HG38)

Remap one支持从HG19/GRCH37到HG38/GRCH38的RAW或VCF文件,或者相反方向.

$14.55

你一眼就买下

你收到吗?
源文件中能唯一映射到另一受支持参考基因组版本的位点。 RAW 输入会交付压缩 RAW 和压缩 VCF。VCF 输入会交付压缩 VCF。
封面
一个受支持的 RAW 或 VCF 文件,在 HG19/GRCh37 与 HG38/GRCh38 之间转换。
访问
一次性坐标转换。下载可用期限随交付结果显示。
需要吗?
需要兼容的 HG19 或 HG38 源文件,并明确指定目标参考基因组版本。
未列入
无法映射或映射结果不明确的位点将被排除。不包含 T2T 读段比对、基因型填补或新的变异识别。

购买后按订单说明提交源文件。前往已购产品页面下载转换结果,并标明输出所用的参考基因组版本。

查看已购产品
  • 识别源文件的参考基因组版本
  • RAW 输入生成 RAW 和压缩 VCF 文件,VCF 输入生成压缩 VCF 文件
  • 仅输出可明确映射到另一参考版本的位点
Buy DNA 坐标转换(HG19 与 HG38)

遵循您命令所显示的文件提交指令。请检查该工作流程中的处理、 同意和保留信息以及 隐私政策. 仅研究和教育用途;这些转换的档案不用于临床诊断或医疗决定。

在你点菜前

留着这栋楼
在背景方面。

参考坐标影响记录的位置,而不是是否测量了额外的DNA.

参考基因组构建是什么?

参考基因组构建是用来描述每个染色体上位置的坐标系统. HG19/GRCH37和HG38/GRCH38是不同的构建;接收工具可能需要特定的构建.

在订购前我需要识别源头吗?

服务会检测一个支持的输入是否在 HG19 或 HG38 中, 并转换到相反的构建。您仍应该检查哪个构建您的目的地需求 。

支持哪些文件类型 ?

支持的输入包括兼容的RAW DNA导出和VCF文件,以 HG19/GRCH37 或 HG38/GRCH38 格式或构建不清的方式进行平面或压缩。联系支持 。

我收到什么RAW输入?

RAW 输入器接收了一个ziped 消费风格的 RAW 文件, 以及一个在转换结构中被映射, 测试过的相同位置的压缩 VCF 。 VCF 不是一个全基因组文件 。

我收到什么 VCF 输入?

在相反支持的构建中,VCF输入得到压缩的VCF.

升迁期间能否失去职位?

是的, HG19 和 HG38 之间没有清晰映射的位置不在此列。请保留您的原始文件,在下游使用前审查转换结果 。

这是否执行 T2T 对齐或计算 ?

号.此服务重映射 HG19 和 HG38 之间已支持的坐标,它不调整序列读取, 创建组装或推断未类型变体 。

结果适合医疗决定吗?

否. Fellowover 用于研究和教育工作流程,转换的文档不用于临床诊断或医疗决定.

格式而不是构建 ?

如果您的坐标已经在正确的构建中, 格式转换可能是相关的服务 。

妇女权益基金改为妇女权益基金

编制兼容的变体数据作为RAW文本.

探索 VCF 到 RAW
DNA 坐标升空

使用您工具所期望的坐标系统 。

审查所需的构建,保留您的原始文件,并订购相应的HG19/HG38升空.

2018年起阅读古代和现代DNA.

DNA Genics 自 2018 年 开始 建立 祖先 和 DNA 分析报告 。我们的报告来自我们团队开发并审查的 与 自己 的 参考 面板 、 计算器 和 古代基因组 比较 的 多年工作,它们不是在苍蝇上生成的,也不是作为副项目组装的。我们只使用 AI 来进行明确标记的可选特性 。

关于DNA基因学
  • Since 2018 开发祖源和生物信息学工具已有 8+ 年。
  • 我们自己的软件 Admixture Studio 和 DNA Kit Studio 是我们自 2018 年起提供的桌面分析工具。
  • 内部管道 其结果由我们自己的生物信息学管道计算,用于估算、分阶段、提升和祖先模型。
  • 一家注册的欧盟公司 DNA Genics, S.L.),总部位于西班牙,受欧盟数据保护法管辖.