不同资讯.
不同的工作流程.
在选择上传或转换前, 确定源格式。 仅一个扩展不能确认是否合适 。
消费者RAW 基因型
使用现有的 RAW 上传来进行兼容的提供者导出。文件结构和可用的标记会被上传工作流程检查 。
审查 RAW 上传VCF / BCF / PLINK 维基百科中的相关条目: 维基百科中的相关条目: 维基百科
从现有的变体或基因类型记录中选择一个转换. PLINK输入需要匹配的BED,BIM和FAM集.
审查格式服务对应 BAM / CMAM 数据
选择 WGS 至 RAW 基因型处理或 T2T 调整。请检查输入参考和染色体覆盖度 。
审查WGS处理FASTQ 读取
在下游基因型或对齐使用之前,先进行读取处理和参考对齐。确认对齐和读取技术。
审查 FASTQ 处理寻其源.
检查实际出口.
列出的版本指明了共同的起点,提供人的名字用于识别,但不暗示隶属关系或认可。
使用列标题进行排序。在小屏幕上,在表格中滚动以读取每个列。
| 起点 | 检查什么? | ||
|---|---|---|---|
| 23andMev5 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 23andMev4 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 23andMev3 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| AncestryDNAv2 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| AncestryDNAv1 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| MyHeritagev2 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| MyHeritagev1 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| FamilyTreeDNA家庭查找器 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| LivingDNAGSA v2 (英语). | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| Nebula Genomics30辆WGS | 测序数据 | 匹配顺序格式 | 请确认文件是测序读段、比对结果还是变异判定，并核对参考基因组及染色体覆盖范围。 |
| 但丁实验室WGS | 测序数据 | 匹配顺序格式 | 请确认文件是测序读段、比对结果还是变异判定，并核对参考基因组及染色体覆盖范围。 |
| 由基因生成的基因GPS 来源 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 24Genetics自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 国家地理热那亚2.0 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| WeGene自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 吉纳拉自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| TellMeGen自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| TellMeGen30辆WGS | 测序数据 | 匹配顺序格式 | 请确认文件是测序读段、比对结果还是变异判定，并核对参考基因组及染色体覆盖范围。 |
| 阿德特罗自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| Sequencing.com各种 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| Sequencing.comWGS | 测序数据 | 匹配顺序格式 | 请确认文件是测序读段、比对结果还是变异判定，并核对参考基因组及染色体覆盖范围。 |
| YSEQWGS | 测序数据 | 匹配顺序格式 | 请确认文件是测序读段、比对结果还是变异判定，并核对参考基因组及染色体覆盖范围。 |
| SelfDecode自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| 默 达自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
| SomosAncestria自定义 | 导出 RAW 基因型文件 | RAW 上传要求 | 文件实际结构、芯片版本及可用标记覆盖范围。 |
没有列出的提供者匹配这些过滤器。在发送遗传数据之前, 联系到文件类型和版本 。
没有列出源保证与每项服务兼容。请咨询上传检查和目的地当前要求 。
保持覆盖和参考。
不同格式并不意味着新的DNA测量。缺少记录和无支持的变异类型仍然很重要。
- 参考构建
- 变换位置必须匹配下一个工具所期望的组装。 升空和读取调整是不同的操作 。
- 覆盖范围
- 定向的、放出体的和染色体的文件不包含全基因组覆盖。过滤过的VCF可能只包含一个调用子集。
- 数据处理
- 在分享遗传信息之前,先阅读目前的提交说明、处理目的、保留通知和隐私政策。
列入清单的供应商是否保证兼容性?
不. 提供者和版本是一个起点。 实际文件结构、 染色体和标记覆盖、 参考构建和选定服务决定是否合适 。审查上传检查或请求支持 。
我可以上传一个序列文件作为RAWDNA?
编号 FASTQ 读取, BAM/ CMAM 校正和变位调用文件包含来自消费者 RAW genotype 导出的不同信息。 选择您所拥有文件的支持工作流程 。
如果我有VCF,BCF或PLINK文件呢?
使用相应的服务指南. VCF 和 BCF 转换受源调用的限制; PLINK 转换需要匹配 BED, BIM 和 FAM 文件.请在订购前检查引用构建和 Allee 编码.
转换能否恢复缺失的测量标记 ?
不,格式转换重组了现有的记录。统计估算是一种单独的推论方法,排序处理取决于实际提供的读数。
另一个网站会接受产出吗?
接收服务控制自己的认可格式、覆盖面、参考构建和规则。在订购前请检查这些要求;在此不承诺普遍接受。
如果我的供货商不在名单上,我该怎么办?
联系提供者、文件类型和版本信息。在您审查过适当的提交指令和处理目的之前,请不要发送遗传文件 。
我在哪里可以审查基因数据的处理?
在提交文件前使用当前上传或命令指令、服务特定保留通知和隐私政策。本指南不上传数据或开始处理。
DNA文件的起点
在提供您的数据前审查匹配服务或上传要求 。