参考选择会改变分析上下文.
当您下一个工作流程需求读取与 T2T- CHM13 对齐时, 选择此服务。 输出是检查和在兼容的研究工具中使用的对齐 。
- 坐标分类 BAM序列读取与 T2T-CHM13 v2.0 对齐,准备为相同的引用配置工具.
- BAM 指数相应的BAI指数支持在兼容软件中访问基因组区域.
- 对齐统计调整统计和涵盖范围汇总衡量标准,以帮助审查处理产出。
- 清晰的软件包边界VCF变位调用,注释和RAW基因型转换不包括在内. 排序对齐不命令这些单独的操作.
- 读取文件
- 支持FASTQ和压缩FASTQ.GZ,完整单端或配对端的读数设定为一人.
- 排序平台
- 现有服务描述的是短读和长读处理。如果合适性不明,请在订购前确认您的平台和读取类型 。
- 参考背景
- 输出使用T2T-CHM13 v2.0. 下游坐标,说明和工具需要匹配该参考.
从资料来源到经过审查的对齐。
购买与文件传输是不同的步骤。请遵从您订购的服务指令 。
确认读集
确定需要T2T对齐的测序平台,配对和研究工作流程.
为命令提供文件
完成现有采购并遵循订单's 传输指令。确认任何共享文件链接允许预定的下载。
审查调整软件包
将 BAM 、 索引和统计一起检查。在下次分析中使用匹配的参考资源 。
你点的包裹。
将可完成的任务和投入要求放在一起审查。显示的价格使用您的显示货币;计费以欧元计。
现有服务/一个订单
FASTQ 读段比对至 T2T
仅对齐输出。本软件包中不包括调用变量和 VCF 。
$58.20
你一眼就买下
- 你收到吗?
- 将测序读段比对到 T2T-CHM13 v2.0 参考基因组，并提供索引和统计数据。 按坐标排序的 BAM 文件、BAI 索引及比对统计文件。
- 封面
- 对一套受支持的 FASTQ 读段执行一次比对。
- 访问
- 一次性比对。请查看交付文件的可用下载期限。
- 需要吗?
- 需要兼容的 FASTQ 读段和订单要求的完整数据集。请先核对测序平台、配对方式和传输要求。
- 未列入
- 不包含变异识别、VCF 输出或新的测序。更换参考基因组无法保证覆盖范围改善。
购买后按订单说明传输读段数据。查看处理状态，待文件可用后从已购产品页面下载 BAM、索引和统计文件。
查看已购产品- 按坐标排序的 BAM 文件
- BAM 索引
- 比对统计
- 明确列出的交付范围
仅对齐输出 调用变体和 VCF 不在此包中 。 转换不能保证第三方服务接受 。
- 选择目的
- 对您订购的服务使用指令。文件存储、接收、验证和完成处理是不同的阶段。
- 保持你的源头
- 保存原始备份并下载您需要的输出 。审查上传和结果通知 。
- 研究限制
- 输出支持兼容的研究工作流程,它不是临床诊断,医学建议或身份证明.
什么是 T2T-CHM13？
这是一个来自Telomere-to-Telomere项目的人类参考集合。这项服务使用指定的 v2.0 参考集合进行对齐。参考集合不是您个人基因组的重建 。
这是否包括一个VCF?
号.此软件包提供对齐的BAM,其BAI指数和对齐统计,变位调用是一个单独的操作,不包含.
这跟升空一样吗?
编号 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 。 : :对齐位置 :对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 。对齐位置 。对齐位置 : 。 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。对齐位置 :对齐位置 。 :对齐位置 : 。 。 :对齐位置 : 。对齐位置 : 。 : 。对齐位置 。 。 : 。 。对齐位置 。 :对齐位置 。 。 。 。 。 。 。 。 。 : 。 。
我可以提供现有的BAM还是CRAM?
对现有对齐使用单独的 BAM/ CMRAM 到 T2T 服务。此页面用于支持的 FASTQ 读取输入 。
能否确保扩大覆盖面?
号. 引用会改变对齐上下文,但可获得的信息仍然取决于原始读数及其质量和深度,它不会排序新的DNA.
我怎么提供文件和检查时机?
如果一个文件链接或读取类型需要检查,则遵守命令和联系支持的传输指令。 处理取决于输入大小和工作量;此页面不会保证完成时间 。
我能用这个做临床决定吗?
不,这是一个研究处理服务,不是临床诊断测试,不应指导医疗决定。