אותן קריאות,
ביישור לייחוס אחר.
יישרו מחדש נתוני ריצוף נתמכים בפורמט BAM או CRAM לייחוס T2T-CHM13 v2.0. הכירו את קובץ ה-BAM עם האינדקס ואת סטטיסטיקות היישור הכלולות בשירות.
$66.49הזמנה אחת. השירות ודרישות הקבצים מאושרים בעת התשלום
השירות מיישר מחדש את הקריאות לייחוס. הוא אינו כולל קריאה לווריאנטים או יצירת קובץ VCF.
היישור מחדש מתחיל מקריאות הריצוף.
קובץ היישור מכיל קריאות שממוקמות מול ייחוס. השירות מחלץ את הקריאות הנתמכות ומיישר אותן מחדש ל-T2T-CHM13, במקום להסתפק בשינוי הקואורדינטות.
- קובץ BAM לאחר יישור מחדשיישור ממוין לפי קואורדינטות ל-T2T-CHM13 v2.0, לכלים תואמים שמשתמשים בייחוס זה.
- האינדקס והסטטיסטיקותלפלט מצורפים אינדקס BAM, סטטיסטיקות יישור וסיכום מדדי כיסוי.
- יישור בלבדהשירות אינו כולל קריאה לווריאנטים, יצירת VCF או המרה ל-RAW. בחרו שירות נפרד אם אתם צריכים את הקבצים האלה.
בדקו את הייחוס ואת קובץ המקור.
השתמשו באותו הרכב ייחוס ביישור ובניתוח הבא. הקריאות הקיימות, איכותן ותוכן הקובץ קובעים את גבולות העיבוד.
גלו את תאימות הקבצים- יישור קיים
- קובץ BAM או CRAM נתמך עם קריאות מיושרות של אדם אחד. ציינו את הייחוס המקורי אם אתם מכירים אותו.
- הכנת הקובץ
- פעלו לפי דרישות האימות והשליחה בהזמנה. כלי ההעלאה מבהירים את פרטי הייחוס המקובלים ואת מגבלות הקבצים.
- תוכן הקריאות
- יישור מחדש אינו משחזר קריאות שנעדרות מהמקור. נתוני ריצוף ממוקד, אקסום או כרומוזומים מוגדרים נשארים בטווח המקורי שלהם.
מקריאות המקור ליישור שאפשר לבדוק.
הרכישה ושליחת הקבצים הם שני שלבים נפרדים. פעלו לפי הוראות השירות בהזמנה.
בדקו את היישור המקורי
זהו את סוג הקובץ, את הקריאות ואת הייחוס המקורי. שאלו את התמיכה לפני ההזמנה אם פרטי הקובץ חסרים או אינם ודאיים.
שלחו את הקובץ ליישור מחדש
הזמינו את השירות ופעלו לפי הוראות שליחת הקבצים או העלאתם בהזמנה. ודאו את מטרת היישור מחדש.
השתמשו בייחוס החדש בניתוחים הבאים
בדקו את קובץ ה-BAM, את האינדקס ואת הסטטיסטיקות, ואז השתמשו בקואורדינטות ובהערות התואמות ל-T2T בניתוחים הבאים.
מה כלול בהזמנה
בדקו יחד את קובצי הפלט ואת דרישות הקלט. המחירים מוצגים במטבע שנבחר, והחשבונית מונפקת באירו.
שירות עיבוד בהזמנה אחת
יישור מחדש של קובצי BAM או CRAM ל-T2T
השירות מיישר מחדש את הקריאות לייחוס. הוא אינו כולל קריאה לווריאנטים או יצירת קובץ VCF.
$66.49
Your purchase at a glance
- You receive
- Existing supported reads realigned to T2T-CHM13 v2.0, with an index and statistics. Realigned BAM, its index and alignment-statistics files.
- Covers
- One realignment order for the supported single-person BAM or CRAM source.
- Access
- One-time realignment processing; review order status and delivered-file availability.
- You need
- A compatible aligned BAM or CRAM. Confirm the source reference, alignment state and transfer requirements before ordering.
- Not included
- No VCF, variant annotation, new sequencing or guaranteed coverage improvement. Realignment is distinct from coordinate liftover.
After purchaseSubmit the source alignment using its order instructions. Follow validation and processing status, then obtain the realigned BAM, index and statistics from the purchased product.
Open your purchases- קובץ BAM לאחר יישור מחדש
- האינדקס והסטטיסטיקות
- יישור בלבד
השירות מיישר מחדש את הקריאות לייחוס. הוא אינו כולל קריאה לווריאנטים או יצירת קובץ VCF. ההמרה אינה מבטיחה שהקובץ יתקבל בשירות חיצוני.
בדקו את אופן העיבוד לפני שיתוף הקובץ.
הקבצים מעובדים מחוץ לדפדפן. עיינו במטרה שצוינה, בהוראות השליחה ובמידע השמירה לפני הגשת קובץ גנטי.
קראו את מדיניות הפרטיות- מטרת העיבוד
- פעלו לפי הוראות השירות שהזמנתם. אחסון, קבלה, אימות והשלמת העיבוד הם שלבים נפרדים.
- שמרו את הקבצים המקוריים
- שמרו עותק מקורי והורידו את הקבצים שאתם צריכים. עיינו בהודעות ההעלאה והתוצאות כדי לדעת את תקופת השמירה החלה.
- גבולות השימוש למחקר
- הפלט מיועד למחקר תואם. הוא אינו מספק אבחון קליני, המלצה רפואית או הוכחת זהות.
היקף השירות ומגבלותיו
בדקו את סוג הקובץ הנדרש ואת מפרט הפלט לפני ההזמנה.
קראו את תיעוד ייחוס T2Tהאם זה שירות להעברת קואורדינטות?
לא. השירות מחלץ קריאות נתמכות מיישור קיים ומיישר אותן מחדש ל-T2T-CHM13. העברת קואורדינטות של וריאנטים היא תהליך נפרד.
האם אקבל תוצאות של קריאה לווריאנטים?
לא. הקבצים שנמסרים כוללים קובץ BAM לאחר יישור מחדש, את האינדקס שלו וסטטיסטיקות יישור. הם אינם כוללים קובץ VCF או הערות לווריאנטים.
האם אפשר להעלות קובץ BAM עם קריאות לא מיושרות?
פעלו לפי כללי האימות המתוארים בהזמנה הנוכחית. השירות בתשלום דורש קובץ BAM או CRAM שכבר יושר. שאלו את התמיכה לפני ההזמנה אם אינכם בטוחים במצב היישור או בייחוס שבו השתמשו.
האם השירות מגדיל את כיסוי הריצוף?
לא. יישור מחדש משנה את מיקום הקריאות הקיימות ביחס לייחוס. הוא אינו יוצר קריאות ריצוף חדשות ואינו מבטיח שיפור מסוים בכיסוי.
מה עושים אם יש קובצי FASTQ?
עיינו בשירות היישור הנפרד מ-FASTQ ל-T2T. בחרו את השירות המתאים לקובצי קריאות שטרם יושרו.
מתי אפשר להוריד את התוצאות?
עקבו אחר סטטוס ההזמנה ואת הוראות המסירה העדכניות. גודל הקובץ, האימות שלו והיקף העבודה משפיעים על העיבוד. עיינו במידע השמירה של השירות ושמרו עותקים של הקבצים שאתם צריכים.
האם אפשר להשתמש בשירות זה לניתוח קליני?
לא. השירות מיועד למחקר, ואין להשתמש בו לאבחון קליני או להחלטות רפואיות.
שירותים לקבצים
בפורמטים אחרים.
יישור FASTQ ל-T2T
יישרו קריאות גולמיות אם עדיין אין לכם קובץ BAM או CRAM לאחר יישור.
גלו את השירותהמרת נתוני גנום שלם ל-RAW
בחרו חילוץ גנוטיפים אם אתם צריכים קובץ RAW.
גלו את השירותבחרו את הייחוס שהניתוח שלכם דורש.
בדקו את קובץ המקור, את הפלטים ואת דרישות השירות לפני שממשיכים.