בדקו מקטעים משותפים לאורך הכרומוזומים.
עיינו באורך המשותף הכולל בסנטימורגן, במספר המקטעים, בדפדפן הכרומוזומים ובטבלת המקטעים. ניתוח IBD2 אופציונלי יכול להציג אזורים זהים בשני העותקים ומדדים סטטיסטיים לקרבה.
משווה הקבצים הגולמיים, כלי חינמי שפועל מקומית בדפדפןשני קבצי DNA.
שני קבצי DNA.
והשוואה מפורטת.
בחרו שני קבצי נתונים גולמיים נתמכים מהמכשיר. עיינו במקטעים ובסמנים המשותפים ובהתאמת הגנוטיפים, וראו את הראיות ואת גבולותיהן לצד התוצאה.
הקבצים נשארים בדפדפן בזמן ההשוואה. הכלי המקומי חינמי וזמין בלי חשבון.
שתי תצוגות לתוצאותטווחי המקטעים.
טווחי המקטעים.
וקריאות של כל סמן.
כל השוואה מספקת ניתוח של המקטעים המשותפים והשוואה של שני הקבצים ברמת סמני SNP. שתי התצוגות משלימות זו את זו.
עיינו בסמנים המשותפים ובמידת ההתאמה שלהם.
עיינו בסמנים שאפשר להשוות, בהתאמות מלאות וחלקיות, בהבדלים, בסיכומי כרומוזומים וברשימה מוגבלת של סמנים שונים. שיעור התאמה גבוה נשאר מוגבל במשמעותו אם הוא נשען על מעט סמנים.
לפני שמתחילים בהשוואה
הכינו שני קבצים שאפשר להשוות.
השתמשו בקבצים שיש לכם הרשאה לנתח, שמרו את העותקים המקוריים ובדקו שאפשר להשוות את הפורמטים ואת קואורדינטות הייחוס.
התאמת קבצים- מקור הקובץ והפורמט שלו
- השתמשו בקובץ גולמי נתמך. אפשר לבחור עותקים דחוסים נתמכים בפורמט ZIP או GZIP בגבולות כלי בחירת הקבצים.
- גרסת גנום הייחוס
- ההתאמה לבדה אינה מאמתת את גרסת גנום הייחוס או את כיוון הגדיל. הכינו שני קבצים תואמים לפני שמפרשים הבדלים.
- הסמנים המשותפים
- בדיקות עשויות למדוד מיקומים שונים. עיינו במספר הסמנים שאפשר להשוות לצד שיעור ההתאמה.
- הסף המינימלי
- האורך המינימלי בסנטימורגן ומספר סמני SNP משפיעים על רשימת המקטעים המוצגת. השתמשו באותן הגדרות כשמשווים הרצות שונות.
שלבי ההשוואה המקומית
בחרו קבצים, כווננו הגדרות ובדקו תוצאות.
ההשוואה מתבצעת במכשיר. בחרו את הקבצים התואמים ואת ההגדרות המתאימות.
בחרו את שני הקבצים
קבצים גולמיים במכשירבחרו את שני הקבצים וודאו שיש לכם הרשאה לנתח אותם. הכלי קורא את שני הקבצים בדפדפן.
עיינו בהגדרות
סף סנטימורגן, סמני SNP ואפשרות IBD2בחרו את הסף המינימלי למקטעים ואת האפשרויות הזמינות. אפשר לבטל את ההשוואה ממסך התקדמות התהליך.
קראו את הערות האיכות
מקטעים והתאמהבדקו את שתי תצוגות התוצאות. ההשוואה עשויה לספק מידע שימושי על סמני SNP גם אם אף מקטע משותף לא חצה את הגבולות שנבחרו.
פרשו את התוצאות בגבולות הראיותכלי למחקר.
כלי למחקר.
ותוצאות שראוי לבחון.
פירוש של מקטעים משותפים ושל אומדני קרבה דורש מידע גנטי וראיות גנאלוגיות עצמאיות. ההתאמה לבדה אינה מספיקה לאימות זהות או לגילוי שגיאות בקבצים.
אין להשתמש בתוצאות להחלטות רפואיות, פליליות או משפטיות. הגנו על קבצים גנטיים ושתפו רק תוצאות שאתם רוצים לחשוף.
כבר משתמשים במנהל הנתונים?
כלי השוואת הבדיקות העצמאי פועל עם דגימות שמורות זכאיות אחרי התחברות והפעלת האפשרות לאפשר השוואה.
גלו את כלי השוואת הבדיקותמדיניות הפרטיותשאלות נפוצות
הכירו את מה שההשוואה יכולה להבהיר.
עיינו קודם בקבצים, ואז הביאו בחשבון את הכיסוי ואת גבולות הפירוש.
האם הקבצים מועלים לאתר?
לא. ההשוואה מתבצעת בדפדפן, הקבצים נשארים במכשיר והתוצאה אינה נשמרת בחשבון. השתמשו בשני הקבצים רק אם יש לכם הרשאה לנתח אותם.
האם צריך חשבון או רכישת השירות?
ההשוואה המקומית חינמית וזמינה בלי חשבון. כדי להשוות דגימות שנשמרו במנהל הנתונים, התחברו ועיינו בדרישות הגישה של אותו כלי.
אילו קבצים אפשר להשוות?
השתמשו בקבצים הגולמיים הנתמכים מ-23andMe, מ-AncestryDNA, מ-FTDNA, מ-MyHeritage או מ-LivingDNA. אפשר לבחור עותקים דחוסים נתמכים בפורמט ZIP או GZIP. עיינו במגבלות בחירת הקבצים, כי ההתאמה תלויה ביותר מהסיומת ומשם הספק.
מה אם שני הקבצים מסתמכים על שתי גרסאות שונות של גנום הייחוס?
הכינו שני קבצים שאפשר להשוות לפני שמפרשים תוצאות. התאמת גנוטיפים לבדה אינה מאמתת את גרסת גנום הייחוס או את כיוון גדיל ה-DNA. הבדלים בייחוס או בהכנת הקבצים עלולים להוביל לתוצאות מטעות.
למה ייתכן שלא יופיעו מקטעים?
זיהוי מקטעים תלוי באורך המינימלי בסנטימורגן ובמספר סמני SNP. ההשוואה עדיין מציגה סיכום של הסמנים המשותפים גם אם אף מקטע לא עמד בגבולות האלה.
האם שיעור התאמה גבוה מוכיח ששני הקבצים שייכים לאדם אחד?
לא. ההתאמה תלויה בסמנים שאפשר להשוות ובמידת החפיפה ביניהם. היא לבדה אינה מספיקה כדי להוכיח זהות, כי מעט סמנים משותפים, הבדלי שבבי בדיקה ואופן הכנת הקבצים משפיעים עליה.
איך מפרשים אומדן קרבה?
התייחסו אליו כאל מדד סטטיסטי למחקר שמבוסס על DNA משותף. הוא אינו מספיק כדי להוכיח קרבה מסוימת, לשמש ראיה קלינית, פלילית או משפטית, או להוכיח זהות.
משווה קבצי DNA גולמיים
בדקו את שני הקבצים ביתר פירוט.
בחרו שני קבצי נתונים נתמכים מהמכשיר ובדקו מקטעים משותפים לצד ההשוואה ברמת סמני SNP.