מקריאות ריצוף
לגנוטיפים שאפשר להשתמש בהם.
הכינו נתוני ריצוף FASTQ נתמכים לשימוש בכלי מחקר שמקבלים RAW. בדקו את דרישות הקלט ואת קבצי הכרומוזומים שאפשר לקבל לפני ההזמנה.
$66.49הזמנה אחת. השירות ודרישות הקבצים הסופיות מאושרים בתשלום
איכות הריצוף והכיסוי מגבילים את הפלט. שם הפורמט לבדו לא מוכיח שהקובץ מתאים.
הקריאות מעובדות לפני הכנת קובץ RAW.
קבצי FASTQ מכילים קריאות ריצוף. העיבוד שלהם שונה מעיבוד קבצי BAM או CRAM שכבר יושרו, או מקבצי VCF שבהם נרשמו וריאנטים.
- קבצי RAW שנוצריםקובץ גנוטיפ RAW נתמך וקבוצה קטנה יותר של סמנים, על בסיס נתוני ריצוף שמישים. אין הבטחה לכיסוי מלא או לקבלה של הקבצים בפלטפורמה אחרת.
- קבצים הקשורים לענפי שושלתאומדני Y-DNA ו-mtDNA וקבצי הכרומוזומים המתאימים, כשהקריאות הנדרשות זמינות והשירות תומך בהן.
- חילוצי כרומוזומים זמיניםקבצי BAM, VCF ו-FASTA של המיטוכונדריה, וחילוצים נתמכים של כרומוזום Y או חילוצים משולבים למחקר המשך. בדקו את דרישות הכלי המקבל.
התחילו מקובץ המקור המתאים.
בחרו שירות לפי הקובץ שיש לכם. קבצי גנוטיפ, וריאנטים, יישור וקבוצות קריאות מכילים מידע שונה.
גלו תאימות קבצים- הקריאות והצימוד שלהן
- מסרו את קבוצת FASTQ המלאה של אותו אדם. ציינו אם הקריאות הן בקצה אחד או בקצוות מזווגים, והבהירו את צימוד הקבצים.
- טכנולוגיית הריצוף
- עדכנו את התמיכה בפלטפורמת הריצוף, בסוג הקריאות ובדחיסה לפני ההזמנה אם אינכם בטוחים לגבי התאימות. איכות הקלט משפיעה על הגנוטיפים הזמינים.
- בחרו שירות לפי הקובץ
- אם יש לכם קובץ BAM או CRAM אחרי יישור, עיינו בשירות המרת נתוני ריצוף גנום שלם ל-RAW. אם יש לכם קובץ VCF, עיינו בשירות המרת VCF ל-RAW.
הכינו את הקבצים המקוריים ובדקו את הפלט.
הרכישה ושליחת הקבצים הם שני שלבים נפרדים. עקבו אחרי הוראות השירות שמפורטות בהזמנה.
זהו את קבוצת הקריאות
בדקו שהקבצים שייכים לדגימה אחת ושהספק סיפק את כל הקריאות הנדרשות.
הזמינו את ההמרה
בחרו את השירות ועקבו אחרי הוראות שליחת הקבצים בהזמנה. בדקו את הדרישות לפני שמשתפים קבצי ריצוף גדולים.
בדקו את הקבצים שהתקבלו
עיינו בקבצי RAW ובכרומוזומים הזמינים. שמרו את הקריאות המקוריות והורידו את התוצאות שתצטרכו בהמשך.
מה כלול בהזמנה
בדקו את הקבצים שנוצרים ואת דרישות הקלט יחד. המחירים מוצגים במטבע שנבחר, והחשבונית מונפקת באירו.
שירות עיבוד בהזמנה אחת
המרת FASTQ ל-RAW
איכות הריצוף והכיסוי מגבילים את הפלט. שם הפורמט לבדו לא מוכיח שהקובץ מתאים.
$66.49
Your purchase at a glance
- You receive
- RAW genotype outputs and available lineage-related and chromosome files. Downloadable RAW and supported chromosome outputs derived from usable sequencing reads.
- Covers
- One managed conversion order for the supported complete sequencing read set.
- Access
- One-time processing; check the order status and delivered files' availability dates.
- You need
- Supported FASTQ reads with suitable quality and coverage. Supply the complete paired-end set where applicable and confirm unusual read types before purchase.
- Not included
- No new DNA sequencing, guaranteed chromosome completeness or clinical interpretation. Missing chromosome reads cannot be supplied by conversion.
After purchaseFollow the sequencing-transfer instructions for the order. Review validation and processing status, then open the purchased product for available downloads.
Open your purchases- קבצי RAW שנוצרים
- קבצים הקשורים לענפי שושלת
- חילוצי כרומוזומים זמינים
איכות הריצוף והכיסוי מגבילים את הפלט. שם הפורמט לבדו לא מוכיח שהקובץ מתאים. ההמרה לא מבטיחה ששירות חיצוני יקבל את הקובץ.
בדקו את אופן העיבוד לפני שיתוף הקובץ.
צוות השירות מעבד את הקבצים מחוץ לדפדפן. בדקו את המטרה שצוינה, את הוראות השליחה ואת מידע השמירה לפני שמגישים קובץ גנטי.
קראו את מדיניות הפרטיות- מטרת העיבוד
- עקבו אחרי הוראות השירות שהזמנתם. אחסון, קבלה, אימות והשלמת העיבוד הם שלבים נפרדים.
- שמרו את הקבצים המקוריים
- שמרו עותק מקורי והורידו את הקבצים שאתם צריכים. עיינו בהודעות ההעלאה והתוצאות כדי לדעת מהי תקופת השמירה שחלה.
- גבולות שימוש למחקר
- הפלט מיועד למחקר תואם. הוא לא מספק אבחון קליני, המלצה רפואית או הוכחת זהות.
היקף השירות והגבולות שלו
בדקו את סוג הקובץ הנדרש ואת מפרט הפלט לפני ההזמנה.
האם השירות הזה זהה להמרת VCF?
לא. FASTQ מכיל קריאות ריצוף, ו-VCF מכיל רשומות של וריאנטים גנטיים. בחרו את השירות שמתאים לקבצים שיש לכם.
צריך לשלוח את שני קבצי הקריאות בקצוות מזווגים?
מסרו את קבוצת הקריאות המלאה וסמנו בבירור את שני קבצי הקריאות בקצוות מזווגים. פנו לתמיכה לפני ההזמנה אם אינכם בטוחים לגבי הקבצים, הצימוד, פלטפורמת הריצוף או תאימות הקריאות.
האם כל תוצאה כוללת קבצים של כל הכרומוזומים?
הזמינות תלויה בכרומוזומים שמיוצגים בקלט ובאיכות הקריאות ובכיסוי שלהן. ההמרה לא משחזרת מידע על כרומוזומים חסרים.
האם הקובץ שהומר מבטיח יותר התאמות או תוצאות דמיון גנטי טובות יותר?
לא. כיסוי הסמנים, איכות הקבצים ודרישות הכלי המקבל משפיעים על השימושיות. תוצאות דמיון גנטי סטטיסטי אינן מוכיחות זהות או קשר משפחתי מאומת.
האם זה שירות לבדיקה קלינית?
לא. העיבוד הזה מיועד למחקר ולכלי גנאלוגיה גנטית נתמכים. הוא לא משמש לאבחון קליני או להחלטות רפואיות.
איפה בודקים את דרישות העברת הנתונים והשמירה שלהם?
עקבו אחרי ההוראות העדכניות שמצורפות להזמנה ובדקו את אישור העיבוד ואת מדיניות הפרטיות. בדקו איך שולחים קבצי ריצוף גדולים ומהן דרישות השמירה של השירות לפני השליחה.
שירותים לקבצים
בפורמטים אחרים.
המרת נתוני גנום שלם ל-RAW
השתמשו בקובץ יישור BAM או CRAM תואם.
גלו את השירותיישור FASTQ ל-T2T
צריכים קובץ BAM אחרי יישור? עיינו בשירות היישור הנפרד.
גלו את השירותהכינו את הנתונים לשימוש הבא.
בדקו את קובץ המקור, את הפלטים ואת דרישות השירות לפני שממשיכים.