הקריאות שלכם.
ייחוס אחר.
ישרו קריאות ריצוף נתמכות בפורמט FASTQ לייחוס T2T-CHM13 v2.0. קבלו קובץ BAM עם אינדקס וסטטיסטיקות יישור לשימוש במחקר שנשען על הייחוס הזה.
$66.49הזמנה אחת · פרטי השירות ודרישות הקבצים מאושרים בתשלום
פלט החבילה מוגבל ליישור. הוא לא כולל קריאת וריאנטים גנטיים או קובץ VCF.
בחירת הייחוס משפיעה על הקשר הניתוח.
בחרו בשירות הזה אם השלב הבא דורש קריאות שיושרו ל-T2T-CHM13. אפשר לבדוק את פלט היישור ולהשתמש בו בכלי מחקר תואמים.
- קובץ BAM ממוין לפי קואורדינטותקריאות ריצוף שיושרו ל-T2T-CHM13 v2.0, מוכנות לשימוש בכלים שמוגדרים לעבוד עם הייחוס הזה.
- אינדקס לקובץ BAMאינדקס BAI מתאים מאפשר גישה לאזורי הגנום באמצעות תוכנות תואמות.
- סטטיסטיקות יישורסטטיסטיקות יישור וסיכום מדדי כיסוי לבדיקת תוצאות העיבוד.
- גבולות החבילההחבילה לא כוללת קריאת וריאנטים בפורמט VCF, אפיון שלהם או המרת גנוטיפים ל-RAW. התהליכים האלה מוזמנים בנפרד.
בדקו את הייחוס ואת הנתונים המקוריים.
השתמשו באותה הרכבת ייחוס ביישור ובניתוח הבא. התוצאות תלויות בקריאות הקיימות, באיכותן ובתוכן הקבצים.
בדקו תאימות קבצים- קבצי קריאות
- קבצי FASTQ נתמכים או FASTQ.GZ דחוסים, עם קבוצת הקריאות המלאה בקצה אחד או בקצוות מזווגים לאדם אחד.
- פלטפורמת ריצוף
- השירות תומך בעיבוד קריאות קצרות וארוכות. שאלו על תאימות הפלטפורמה וסוג הקריאות לפני ההזמנה אם צריך.
- הייחוס שבשימוש
- הפלט משתמש בייחוס T2T-CHM13 v2.0. הקואורדינטות, האפיונים והכלים בשלבים הבאים צריכים להתאים לייחוס הזה.
מהקריאות המקוריות לבדיקת היישור
הרכישה והעברת הקבצים הם שני שלבים נפרדים. עקבו אחרי הוראות השירות שמופיעות בהזמנה.
בדקו את קבוצת הקריאות
זהו את פלטפורמת הריצוף, את אופן צימוד הקריאות ואת הניתוח המחקרי שדורש יישור T2T.
שלחו את קבצי ההזמנה
השלימו את הרכישה ועקבו אחרי הוראות העברת הקבצים שבהזמנה. ודאו שהקישורים לקבצים המשותפים מאפשרים להוריד אותם.
בדקו את פלט היישור
עיינו בקובץ ה-BAM, באינדקס ובסטטיסטיקות יחד. השתמשו במשאבים שתואמים לייחוס בניתוח הבא.
מה כלול בחבילה
בדקו את הפלט ואת דרישות הקבצים יחד. המחירים מוצגים במטבע שבחרתם, והחשבונית מונפקת באירו.
השירות הזמין / הזמנה אחת
יישור FASTQ ל-T2T
פלט החבילה מוגבל ליישור. הוא לא כולל קריאת וריאנטים גנטיים או קובץ VCF.
$66.49
Your purchase at a glance
- You receive
- Sequencing reads aligned to the T2T-CHM13 v2.0 reference, with an index and statistics. Coordinate-sorted BAM, BAI index and alignment-statistics files.
- Covers
- One alignment order for the supported FASTQ read set.
- Access
- One-time alignment processing; use the availability dates shown for delivered downloads.
- You need
- Compatible FASTQ reads and the complete read set required by the order. Check platform, pairing and transfer requirements first.
- Not included
- Variant calling, VCF output and new sequencing are not included. A different reference does not guarantee improved coverage.
After purchaseSubmit the read set using the order's transfer instructions. Follow processing status, then download the BAM, index and statistics from the purchased product when available.
Open your purchases- קובץ BAM ממוין לפי קואורדינטות
- אינדקס לקובץ BAM
- סטטיסטיקות יישור
- גבולות החבילה
פלט החבילה מוגבל ליישור. הוא לא כולל קריאת וריאנטים גנטיים או קובץ VCF. ההמרה לא מבטיחה ששירות חיצוני יקבל את הקובץ.
הכירו את אופן העיבוד לפני שיתוף הקבצים.
צוות השירות מבצע את העיבוד מחוץ לדפדפן. בדקו את המטרה שצוינה, את הוראות השליחה ואת מידע שמירת הנתונים לפני שליחת קובץ גנטי.
קראו את מדיניות הפרטיות- הגדירו את המטרה
- עקבו אחרי הוראות השירות שהזמנתם. אחסון הקובץ, קבלתו, האימות שלו והשלמת העיבוד הם שלבים נפרדים.
- שמרו את הקובץ המקורי
- שמרו גיבוי של המקור והורידו את הפלט שאתם צריכים. עיינו בהודעות ההעלאה והתוצאות כדי לדעת מהי תקופת השמירה שחלה.
- גבולות שימוש למחקר
- הפלט תומך בתהליכי מחקר תואמים. הוא לא מתאים לאבחון קליני, להמלצה רפואית או להוכחת זהות.
מה השירות כולל?
בחירת קלט מתאים והבנת מפרט הפלט מקלות על המשך הניתוח.
קראו את תיעוד הייחוס T2Tמהו הייחוס T2T-CHM13?
זו הרכבת ייחוס של הגנום האנושי מפרויקט Telomere-to-Telomere. השירות הזה משתמש בגרסה 2.0 ליישור. הרכבת הייחוס אינה שחזור של הגנום האישי שלכם.
האם החבילה כוללת קובץ VCF?
לא. החבילה כוללת את קובץ ה-BAM שנוצר מהיישור, את האינדקס שלו בפורמט BAI וסטטיסטיקות יישור. קריאת וריאנטים היא תהליך נפרד שלא כלול בחבילה.
האם יישור הוא אותו דבר כמו המרת קואורדינטות?
לא. היישור קובע את מיקום קריאות הריצוף על הייחוס. המרת קואורדינטות מעבירה מיקומים של וריאנטים ידועים בין הרכבות נתמכות, בלי ליישר מחדש את הקריאות המקוריות.
אפשר להגיש קובץ BAM או CRAM קיים?
השתמשו בשירות המרת BAM או CRAM ל-T2T ליישור קיים. העמוד הזה מיועד לקריאות נתמכות בפורמט FASTQ.
האם עומק הכיסוי משתפר בהכרח?
לא. החלפת הייחוס משנה את הקשר היישור, והמידע הזמין עדיין תלוי בקריאות המקוריות, באיכותן ובעומק שלהן. השירות לא מבצע ריצוף חדש של DNA.
איך שולחים קבצים ושואלים על משך העיבוד?
עקבו אחרי הוראות העברת הקבצים שמצורפות להזמנה, ופנו לתמיכה כדי לבדוק קישור או סוג קריאה לפי הצורך. משך העיבוד תלוי בגודל הקלט ובעומס העבודה, והעמוד הזה לא קובע מועד סיום.
האם התוצאות מתאימות להחלטות קליניות?
לא. זה שירות עיבוד למטרות מחקר. הוא לא אומת כבדיקה אבחנתית קלינית, ואין להסתמך עליו לקבלת החלטות רפואיות.
יש לכם סוג קובץ אחר?
בחרו את השירות המתאים.
המרת BAM או CRAM ל-T2T
יישרו מחדש קריאות מקובץ יישור קיים.
הכירו את השירותהמרת FASTQ ל-RAW
צריכים חבילת המרת גנוטיפים לצד היישור?
הכירו את השירותבחרו את הייחוס שהניתוח שלכם דורש.
בדקו את מקור הנתונים, את הפלט ואת דרישות השירות לפני שממשיכים.