מנתוני ריצוף
לקובץ RAW שמיש
המירו קובצי יישור נתמכים בפורמט BAM או CRAM לקובצי גנוטיפ RAW, עם מיצויי כרומוזומים וחיזויי הפלוגרופ כשהם זמינים. התחילו בדרישות הקבצים.
$37.40הזמנה אחת · פרטי השירות ודרישות הקבצים מאושרים בקופה
הכיסוי ותוכן הכרומוזומים קובעים מה אפשר לספק. זהו שירות ההמרה המלא הקיים.
מקובץ יישור לפורמט RAW
השירות מחלץ קריאות גנוטיפ מקובצי יישור ריצוף תואמים. הוא שונה מעיצוב מחדש של קובץ VCF ומיישור של קריאות FASTQ שלא עובדו.
- קובצי גנוטיפ RAWקובץ SuperKit תומך בכ-2.5 מיליון סמנים, ומומלץ להתחיל בו לתאימות הרחבה ביותר, לצד קובצי V5 ו-V3 קטנים יותר לאתרים שמבקשים גרסה מסוימת. הקריאות הזמינות תלויות בכיסוי ובאיכות. שימוש בקבוצת סמנים בעלת שם אינו מבטיח שכל מיקום נמצא בה.
- מדריך תוצאות בשפה פשוטהעמוד בתחילת החבילה שמסביר את תפקיד כל קובץ ואיזה קובץ RAW להעלות קודם. חלצו קודם את חבילת ההורדה כולה כדי שהקישורים במדריך יעבדו, והעלו קובצי RAW דחוסים ב-ZIP כפי שהם.
- חיזויי הפלוגרופחיזויים להפלוגרופי Y-DNA ו-mtDNA כשהקריאות הנדרשות זמינות. חיזוי מצביע על ענף שושלת משותף, ואינו מוכיח מוצא מאדם מסוים או קשר משפחתי.
- מיצויי כרומוזומיםפלטי מיטוכונדריה זמינים בפורמטים BAM, VCF ו-FASTA, עם מיצויי כרומוזום Y ומיצויים משולבים אם קובץ המקור מאפשר זאת. בדקו את דרישות השירות הקולט לפני שימוש בקובץ המיוצא.
התחילו בקובץ המקור המתאים.
בחרו שירות לפי הקובץ שיש לכם. קובצי גנוטיפ, וריאנטים, יישור וקבוצות קריאות מכילים סוגים שונים של מידע.
בדקו תאימות קבצים- קובץ המקור
- קובץ BAM או CRAM מלא שמכיל קריאות מיושרות של אדם אחד. העלאה להמרת RAW רגילה מצפה לייחוס GRCh37/hg19 או GRCh38/hg38.
- כיסוי כרומוזומים
- אי אפשר לשחזר קריאות חסרות של המיטוכונדריה או של כרומוזום Y באמצעות המרת פורמט. קובצי CRAM של חלק מהספקים משמיטים את האזורים האלה.
- כיסוי וסוגי וריאנטים
- נתוני אקסום, ריצוף ממוקד או כרומוזום Y בלבד אינם מספקים כיסוי של הגנום השלם. להמרת RAW יש מגבלות בייצוג של הוספות ומחיקות (INDEL) ושל וריאנטים שאינם SNP.
הכינו את קובץ המקור ובדקו את הפלט.
רכישה והעברת קבצים הם שני שלבים נפרדים. פעלו לפי הוראות השירות שבהזמנה.
בדקו את קובץ היישור
בדקו את סוג הקובץ, את גרסת הייחוס ואת האדם שהנתונים שייכים לו. פנו לתמיכה אם המקור או כיסוי הכרומוזומים אינם ברורים.
הזמינו את השירות המתאים
רכשו את המרת ה-WGS המלאה כשהיא זמינה. פעלו לפי הוראות שליחת הקבצים בהזמנה ואשרו את מטרת העיבוד שצוינה.
בדקו את הפלט ושמרו אותו
עקבו אחר סטטוס ההזמנה, בדקו את הקבצים שנוצרו והורידו את התוצאות הזמינות. בדקו את מידע השמירה שמוצג עבור ההעלאה והתוצאה.
תוכן החבילה
בדקו את הפלטים ואת דרישות הקבצים יחד. המחירים מוצגים במטבע שבחרתם, והחיוב הוא באירו.
השירות הקיים / הזמנה אחת
המרת WGS ל-RAW
הכיסוי ותוכן הכרומוזומים קובעים מה אפשר לספק. זהו שירות ההמרה המלא הקיים.
$37.40
Your purchase at a glance
- You receive
- RAW genotype output, available chromosome extracts and supported haplogroup predictions. Downloadable RAW and chromosome files; available outputs depend on the input reads.
- Covers
- The full conversion service for one complete supported single-person BAM or CRAM alignment.
- Access
- One conversion order. Processing and download status are shown through the existing order and purchased-product workflow.
- You need
- A compatible aligned BAM/CRAM on GRCh37/hg19 or GRCh38/hg38, with suitable coverage and the required chromosome reads.
- Not included
- Y-DNA and mtDNA outputs depend on usable reads. Storing a file in the WGS library does not purchase or start conversion; third-party acceptance is not guaranteed.
After purchaseFollow the file instructions attached to your purchased service. Complete its validation/submission steps, check the order status and download available results from the purchased product.
Open your purchases- קובצי RAW בגרסאות SuperKit, V5 ו-V3
- חיזויי הפלוגרופ
- מיצויי כרומוזומים
- מדריך תוצאות בשפה פשוטה
הכיסוי ותוכן הכרומוזומים קובעים מה אפשר לספק. זהו שירות ההמרה המלא הקיים. ההמרה אינה מבטיחה ששירות חיצוני יקבל את הקובץ.
הבינו את אופן העיבוד לפני שיתוף הקבצים.
העיבוד מתבצע מחוץ לדפדפן, במסגרת השירות. בדקו את המטרה שצוינה, את הוראות השליחה ואת מידע השמירה לפני שליחת קובץ גנטי.
קראו את מדיניות הפרטיות- הגדירו את המטרה
- פעלו לפי הוראות השירות שהזמנתם. אחסון הקובץ, קבלתו, אימותו והשלמת העיבוד הם שלבים נפרדים.
- שמרו את קובץ המקור
- שמרו עותק גיבוי של המקור והורידו את הפלטים שאתם צריכים. בדקו את הודעות ההעלאה והתוצאות כדי לדעת את תקופת השמירה שחלה.
- מגבלות שימוש מחקרי
- הפלטים תומכים בתהליכי מחקר תואמים. הם אינם מיועדים לאבחון קליני, להמלצה רפואית או להוכחת זהות.
מה כולל השירות?
בחירת הקלט המתאים והבנת מפרט הפלט מקלות על המשך הניתוח.
מה כוללת החבילה הזו?
חבילת המרת ה-WGS המלאה מספקת את קובצי ה-RAW ואת קובצי הכרומוזומים הזמינים שמתוארים למעלה. בדקו את כיסוי הקריאות הנדרש ואת השירות שבהזמנה לפני הרכישה.
האם אפשר לשלוח קובץ BAM או CRAM מכל ספק?
הקובץ צריך לעמוד בבדיקות של ההזמנה שנבחרה. המרת RAW רגילה מצפה ליישור מלא של אדם אחד לפי GRCh37/hg19 או GRCh38/hg38. שם הספק לבדו אינו קובע תאימות. פנו לתמיכה אם הפורמט או הייחוס אינם ברורים.
האם פלטי Y-DNA ו-mtDNA מובטחים תמיד?
לא. הקריאות המתאימות צריכות להיות קיימות ושמישות. חלק מייצואי CRAM, כולל קובצי MyHeritage שמתוארים במדריך, חסרים נתוני מיטוכונדריה או כרומוזום Y. לקריאות מיטוכונדריה בפורמט RAW שמופקות מקובצי Nebula CRAM יש מגבלות מתועדות. בדקו את פלטי הכרומוזומים ואת החיזויים בהקשר הזה.
האם התוצאה תעבוד באתר אחר לניתוח DNA?
כל שירות קולט קובע את הפורמטים שהוא מקבל, את כיסוי הסמנים המינימלי ואת שאר הכללים. ההמרה אינה מבטיחה קבלה של הקובץ, התאמה מסוימת או תוצאת דמיון גנטי מסוימת.
איזה קובץ RAW כדאי להעלות?
התחילו בקובץ SuperKit, שתומך בכ-2.5 מיליון סמנים ומציע את התאימות הרחבה ביותר. השתמשו בקובץ V5 או V3 הקטן יותר רק אם האתר דוחה את SuperKit או מבקש את הגרסה הזו. העלו את קובץ ה-RAW הדחוס ב-ZIP כפי שהוא. מדריך התוצאות שמצורף להורדה מסביר את תפקיד כל קובץ.
לאן שולחים קובץ להזמנה קיימת?
פעלו לפי הוראות הקבצים שמצורפות להזמנה. כלי ההעלאה הזמינים לקבצים מתאימים מופיעים באזור הזמנות WGS. שמירת קובץ בספריית WGS הנפרדת אינה רוכשת את שירות ההמרה ואינה מתחילה אותו.
איך מטופלים קבצים גנטיים?
בדקו את אישור העיבוד, את הודעת השמירה ואת מדיניות הפרטיות של אפשרות ההעלאה לפני שליחת הקובץ. הדרישות ותקופות המחיקה עשויות להשתנות לפי השירות. שמרו את הקובץ המקורי והורידו תוצאות שתרצו לשמור.
יש לכם סוג קובץ אחר?
בחרו את השירות המתאים.
המרת VCF ל-RAW
יש לכם תוצאות של קריאת וריאנטים? בדקו את שירות המרת הפורמט.
למדו על השירותהמרת FASTQ ל-RAW
התחילו בקריאות הריצוף, לפני היישור שלהן.
למדו על השירותהכינו את הנתונים לשלב הבא.
בדקו את קובץ המקור, את הפלטים ואת דרישות השירות לפני שממשיכים.