Começa pelas leituras.
Obtenha genótipos utilizáveis.
Prepara dados de sequenciação FASTQ compatíveis para processos de pesquisa baseados em RAW. Verifique o pacote de processamento gerido, os resultados cromossômicos e os requisitos de entrada antes de contratar.
$62.85Um pedido · O serviço e os requisitos definitivos do arquivo são confirmados ao contratar
A qualidade e a cobertura de sequenciação limitam o resultado. O nome do formato não confirma por si só a adequação da entrada.
O processamento de leituras precede a exportação RAW.
Os arquivos FASTQ contêm leituras de sequenciação. Precisam de um processo diferente do de um BAM/CRAM já alinhado ou um VCF com variantes detectadas.
- Resultados RAWResultado RAW de genótipos compatível e uma selecção reduzida de marcadores, com base em dados de sequenciação utilizáveis. Não é garantida cobertura completa ou aceitação por outra plataforma.
- Arquivos relacionados com a linhagemEstimativas de DNA-Y e DNA mitocondrial e resultados cromossômicos correspondentes quando disponíveis as leituras necessárias e o serviço os admita.
- Extractos cromossômicos disponíveisArquivos mitocondriais BAM, VCF e FASTA e extractos do cromossoma Y ou combinados elegíveis para investigação posterior. Consulta os requisitos de arquivos do destino.
Começa pelo arquivo de origem adequado.
Escolha o serviço de acordo com o arquivo que você tem. Uma exportação de genótipos, um arquivo de variantes, um alinhamento e um conjunto de leituras contêm informações diferentes.
Consultar a compatibilidade de arquivos- Leituras e emparelhamento
- Aporta o conjunto FASTQ completo de uma mesma pessoa. Identifica se as leituras são pareadas (paired-end) ou de extremo único (single-end) e mantenha claro o emparelhamento.
- Tecnologia de leitura
- Se houver dúvidas de compatibilidade, indica a plataforma de sequenciação, o tipo de leitura e a compressão antes de contratar. A qualidade de entrada afeta os genótipos disponíveis.
- Escolha o ponto de partida adequado
- Se você já tiver um BAM ou CRAM alinhado, consulte o WGS para o RAW. Se você tiver um VCF, consulte o VCF para o RAW em vez de contratar processamento de leituras.
Prepare a origem. Verifique o resultado.
A compra e a transferência de arquivos são passos diferentes. Siga as instruções do serviço do seu pedido.
Identifica o conjunto de leituras
Verifique se os arquivos correspondem a uma amostra e que o fornecedor tenha fornecido todas as leituras necessárias.
Preparar a conversão
Escolha o serviço e siga as instruções de transferência do pedido. Confirma os requisitos antes de partilhar arquivos grandes de sequenciação.
Verifique os arquivos entregues
Veja os resultados RAW e cromossômicos disponíveis. Conserva as leituras originais e baixe os resultados que você precisa para trabalhar depois.
O pacote que você contrata.
Verifique em conjunto as entregas e os requisitos de entrada. Os preços são apresentados na sua moeda seleccionada; são facturados em EUR.
Servicio existente / Un pedido
Conversão do FASTQ para arquivos RAW
A qualidade e a cobertura de sequenciamento limitam o resultado. O nome do formato não confirma por si só a adequação da entrada.
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Sua compra de uma olhada
- Recebes
- Resultados RAW de genótipos e arquivos de linhagem e cromossômicos disponíveis. Resultados RAW e cromossômicos admitidos descarregados, obtidos de leituras de sequenciamento utilizáveis.
- Inclui
- Um pedido de conversão gerido para o conjunto completo de leituras de sequenciamento compatível.
- Acesso
- Processamento de pagamento único; consulta o estado do pedido e as datas de disponibilidade dos arquivos entregues.
- Precisas
- Leituras FASTQ compatíveis com qualidade e cobertura adequadas. O conjunto pareado completo quando apropriado e confirma os tipos de leitura invulgares antes de comprar.
- Não inclui
- Sem nova sequência de DNA, garantia de integridade cromossômica ou interpretação clínica. A conversão não traz leituras cromossômicas ausentes.
Depois de comprarSiga as instruções de transferência de sequenciamento do pedido. Verifique o estado de validação e processamento e abre o produto adquirido para obter as descargas disponíveis.
Abrir as suas compras (em inglês)- Resultados RAW
- Arquivos relacionados com a linhagem
- Extractos cromossômicos disponíveis
A qualidade e a cobertura de sequenciação limitam o resultado. O nome do formato não confirma por si só a adequação da entrada. A conversão não garante a aceitação por um serviço de terceiros.
Conheça o tratamento antes de compartilhar.
Este é um serviço gerido. Não é um cálculo local do navegador. Verifique a finalidade indicada, as instruções de envio e as informações de conservação antes de fornecer um arquivo genético.
Ler a Política de Privacidade- Confirmar a finalidade
- Use as instruções do serviço contratado. O armazenamento, a recepção, a validação e o processamento completado são fases distintas.
- Conserva o seu arquivo de origem
- Conserva uma cópia do original e descarrega o resultado necessário. Consulta os avisos de subida e resultados para conhecer o período de conservação aplicável.
- Limites de investigação
- O resultado permite processos de pesquisa compatíveis. Não é um diagnóstico clínico, uma recomendação médica ou um teste de identidade.
Tenha claros os limites.
Uma entrada adequada e especificações claras do resultado facilitam o próximo passo.
É o mesmo que converter um VCF?
O FASTQ contém leituras de sequenciamento; VCF contém variantes detectadas. Escolha o serviço adequado para os arquivos que você tem.
Tenho que enviar ambos os arquivos de leituras pareadas?
Oferece o conjunto completo de leituras e identifica claramente os arquivos pareados (paired-end). Contacte o suporte antes de contratar se os arquivos não estiverem claros, o emparelhamento, a plataforma ou a compatibilidade das leituras.
Todos os arquivos incluem todos os resultados cromossômicos?
Sua disponibilidade depende dos cromossomos representados na entrada e da qualidade e cobertura de suas leituras. A conversão não traz a informação cromossômica ausente.
Um arquivo convertido garante mais correspondências ou melhores resultados de ascendência?
Não. A cobertura de marcadores, a qualidade de entrada e os requisitos de cada ferramenta receptora afetam a sua utilidade. Os resultados estatísticos de similaridade genética não demonstram identidade nem uma relação familiar verificada.
É um teste clínico?
Não. Este serviço de processamento está destinado a pesquisa e processos de genealogia genética compatíveis. Não é um serviço de diagnóstico clínico nem uma base para decisões médicas.
Onde consulto os requisitos de transferência e conservação?
Siga as instruções em vigor do pedido e verifique a confirmação de tratamento e a Política de Privacidade. Verifique antes do envio os requisitos de transferência de sequências grandes e a conservação específica do serviço.
Você tem outra entrada?
Um serviço diferente.
WGS para RAW
Utiliza um alinhamento BAM ou CRAM compatível existente.
Consultar o ServiçoFASTQ a T2T
Você precisa de um BAM alinhado em vez de um pacote RAW? Consulta o serviço independente de alinhamento.
Consultar o ServiçoPrepare seus dados para o próximo passo.
Verifique a origem, os resultados entregues e os requisitos do serviço antes de continuar.